Scientific Agent Skills（科研智能体技能库）

# Scientific Agent Skills：安装说明

这个工具包里是 Mindket 写的安装说明，不包含技能本身、它们的脚本或参考文件。这些要从 K-Dense 的仓库安装：https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills

许可证：MIT，Copyright (c) 2025 K-Dense Inc.（许可证文件里的原文）。全文见 https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/blob/main/LICENSE.md

仓库自己的 README 还说明，每个技能在其 SKILL.md 的 license 一行里写有自己的许可证，可能和仓库的 MIT 许可证不同，还可能附带额外条款。Mindket 读了每个 SKILL.md 的前 40 行：大多数写的是 MIT、BSD 或 Apache，少数写的是别的，比如非商业许可证（deepspot-m 用 PolyForm Noncommercial，what-if-oracle 用 CC BY-NC-SA 4.0）、GPL（bioservices、cobrapy、etetoolkit）或专有服务（rowan）。有三个写着 Unknown，四个根本没有 license 一行。你装的每个技能，都请读一读它的 license 一行。这个工具包不包含任何技能，所以不涉及它们的条款。

Scientific Agent Skills 是 K-Dense 的社区项目，并非 Anthropic 制作或背书。

这些说明的来源：README（https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/blob/main/README.md），仓库的 plugin.json 和 SECURITY.md，以及这些说明里提到的技能的 SKILL.md，位于 https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/skills 下。GitHub CLI 的命令说明出自 GitHub 关于 gh skill install 和 gh skill update 的手册（https://cli.github.com/manual/gh_skill_install）。Claude Code 从哪里加载技能，出自 Claude Code 自己的技能页面（https://code.claude.com/docs/en/skills）。所有命令都由 Mindket 照抄，一条也没有运行过。

## 它是什么

一个给编程智能体用的科研技能库：skills/ 下有 170 多个文件夹，每个都有一个 SKILL.md，很多还带参考文件、脚本和模板。README 按领域分组：生物信息学、药物研发、蛋白质组学、临床研究工作流、显微成像和医学影像、神经科学、机器学习、材料、工程、地理空间分析、实验室自动化、科学写作和审稿，以及覆盖 80 个来源的数据库查询。

README 说，智能体自己就能用任何 Python 包。技能为某个软件包、数据库或工作补上整理好的说明、示例和检查，让智能体从写好的指引出发。README 还说，社区贡献的技能可能没有 K-Dense 自己的审查得那么仔细。

## 谁做什么

- 你：只装你需要的技能，确保每个技能的 Python 包装在各自的环境里（你自己装，或者由智能体照着 SKILL.md 里的安装命令装），提供技能要的 API 密钥，并核对智能体的产出。
- 安装器，npx skills 或 gh skill：把技能文件夹放到你的智能体读取的位置。npx skills 可以把它们链接到同一份正本，也可以复制。它不会安装技能运行所需的东西。
- 智能体（Claude、Codex 或其他）：你的请求和某个技能对得上时读取它，然后运行技能里写的命令和脚本。技能里的祈使句都是写给智能体的。
- 技能的脚本：在你的电脑上运行，有些会调用网络服务。README 说技能可以运行代码、安装软件包、发起网络请求和修改文件。

## 工具包里的文件

- setup/choose-skills.md：README 的安全建议，怎么列出并挑选几个技能，以及怎么读每个技能的许可证和依赖
- setup/claude-code.md：Claude Code 的 npx 和 gh skill 安装方式
- setup/codex.md：Codex 的同样两种方式，以及 README 的插件命令
- setup/cursor.md：Cursor 的同样两种方式，以及 README 的插件符号链接方式
- setup/other-agents.md：Gemini CLI、Antigravity，以及扫描 ~/.agents/skills 的智能体，附 README 的克隆命令
- setup/python-and-keys.md：uv、单独的环境、README 列出的系统，以及 API 密钥的例子

## 先准备好这些

- 一个能读取 Agent Skills 的智能体。README 点名了 Cursor、Claude Code、Codex、Google Antigravity、Gemini CLI 和 Claude Cowork。
- uv，一个 Python 包管理器。README 说安装技能依赖时必须用它。
- Python。README 要求仓库自己的工具用 3.13 或更新版本，每个技能各自写明适用的版本范围。
- macOS、Linux，或带 WSL2 的 Windows。这是 README 列出的系统。
- npx 方式需要 Node.js（skills 安装器的 README 要求 22.20 或更新版本），gh skill 方式需要 2.90.0 或更新版本的 GitHub CLI。
- 每个技能说它需要的东西。有些技能不需要密钥，有些可以填一个可选的密钥，有些需要某个服务的账号。

## 装到哪里

- npx skills add：技能文件夹放在智能体自己的技能文件夹里，可以是项目里，也可以是全局。
- gh skill install：同上，并在每个 SKILL.md 的开头加一段来源说明，gh skill update 靠它找到更新。
- 插件方式，用于 Cursor 和 Codex：整个仓库作为一个插件，所有技能都在 skills/ 下。
- Python 包、系统工具和密钥：哪里都不会装。每个技能的 SKILL.md 写着它需要什么，安装技能文件不会装其中任何一样。

## 你的数据

技能文件是文本和脚本。技能做什么取决于技能本身：有些只处理你电脑上的文件，有些会调用公共数据库或服务，比如 PubMed、ClinVar 或 OpenRouter。README 自己的建议是先读每个 SKILL.md，因为里面写着技能会连接哪些外部服务。你交给智能体的内容，会像其他工作一样发给你的智能体服务商。

## 更新和卸载

gh skill update（及其 --all 选项）见 setup/claude-code.md。npx skills update 和 npx skills remove 出自 skills 安装器的 README（https://github.com/vercel-labs/skills）。作者的 README 没有给出卸载步骤。Claude Code 的技能页面说，删除个人或项目技能的文件夹就能卸载它。

README.md  6 KB
setup/choose-skills.md  5 KB
setup/claude-code.md  4 KB
setup/codex.md  2 KB
setup/cursor.md  2 KB
setup/other-agents.md  3 KB
setup/python-and-keys.md  4 KB