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monoyield-predictor

Tsuboyama-Lab · 工具包

预测一条蛋白质序列在大肠杆菌里能以单体形式表达多少，单位为 log10 mg/L。提供 ESMC-6B 和 SaProt 的已训练 LoRA 适配器和回归头，面向蛋白质研究人员。

RFD4-Proteina-Diffusers

nvidia · 工具包

通过 Diffusers 库运行 RFD4-Proteina 蛋白质设计模型，不需要原生 RFD4 包。适合在 CUDA GPU 上围绕靶点设计分子的研究人员。

OpenDDE

aurekaresearch · 工具包

预测蛋白质等生物分子的原子级三维结构，服务于早期药物研究。可在命令行用 GPU、CPU 或 Docker 运行。目前是预览版本。

RFD4-Proteina

nvidia · 工具包

围绕你指定的结合靶点、酶基序或配体，同时设计蛋白质序列和全原子结构。这是 Baker Lab 和 NVIDIA 的研究模型，面向分子设计人员。

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ssinder · 技能

为 AI 编程智能体提供计算生物学技能，涵盖 RNA-seq、单细胞分析、蛋白质结构、分子动力学、多肽设计、文献挖掘和论文图表。